Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gkap1Q9JMB0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gkap1Q9JMB0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gkap1Q9JMB0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gkap1Q9JMB0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms