Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cul3Q9JLV5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul3Q9JLV5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul3Q9JLV5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul3Q9JLV5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.5 ms