Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Aldh9a1Q9JLJ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aldh9a1Q9JLJ2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms