Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgm1Q9JLF6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tgm1Q9JLF6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tgm1Q9JLF6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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