Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nectin3Q9JLB9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nectin3Q9JLB9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nectin3Q9JLB9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nectin3Q9JLB9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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