Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtsmQ9JL96 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsmQ9JL96 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CtsmQ9JL96 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsmQ9JL96 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms