Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgn5Q9JL35 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgn5Q9JL35 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmgn5Q9JL35 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmgn5Q9JL35 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms