Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnot9Q9JKY0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnot9Q9JKY0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms