Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk3aQ9JKX8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Upk3aQ9JKX8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upk3aQ9JKX8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upk3aQ9JKX8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1188.6 ms