Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp39a1Q9JKJ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms