Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trem1Q9JKE2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trem1Q9JKE2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trem1Q9JKE2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms