Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Herpud1Q9JJK5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Herpud1Q9JJK5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Herpud1Q9JJK5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms