Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Caln1Q9JJG7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Caln1Q9JJG7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Caln1Q9JJG7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Caln1Q9JJG7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms