Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smco4Q9JIS3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smco4Q9JIS3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smco4Q9JIS3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms