Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod3Q9JHJ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod3Q9JHJ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod3Q9JHJ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod3Q9JHJ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod3Q9JHJ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod3Q9JHJ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmod3Q9JHJ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmod3Q9JHJ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod3Q9JHJ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.5 ms