Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI9

Slc40a1, Solute carrier family 40 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc40a1Q9JHI9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc40a1Q9JHI9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc40a1Q9JHI9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc40a1Q9JHI9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc40a1Q9JHI9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc40a1Q9JHI9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms