Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn10Q9ESK3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn10Q9ESK3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn10Q9ESK3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn10Q9ESK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms