Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SelenofQ9ERR7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SelenofQ9ERR7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SelenofQ9ERR7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms