Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ripk4Q9ERK0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ripk4Q9ERK0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ripk4Q9ERK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ripk4Q9ERK0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms