Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ParvgQ9ERD8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ParvgQ9ERD8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ParvgQ9ERD8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ParvgQ9ERD8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ParvgQ9ERD8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms