Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcr6Q9EQ16 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cxcr6Q9EQ16 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms