Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TnmdQ9EP64 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TnmdQ9EP64 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TnmdQ9EP64 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TnmdQ9EP64 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms