Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl4Q9DCU6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl4Q9DCU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl4Q9DCU6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mrpl4Q9DCU6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms