Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pop7Q9DCH2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pop7Q9DCH2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pop7Q9DCH2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pop7Q9DCH2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms