Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne8Q9DC53 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpne8Q9DC53 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpne8Q9DC53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms