Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syde1Q9DBZ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syde1Q9DBZ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syde1Q9DBZ9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syde1Q9DBZ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms