Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ftsj3Q9DBE9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ftsj3Q9DBE9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ftsj3Q9DBE9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ftsj3Q9DBE9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ftsj3Q9DBE9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms