Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smg9Q9DB90 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smg9Q9DB90 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smg9Q9DB90 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms