Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc89Q9DA73 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc89Q9DA73 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms