Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tmco5aQ9D9D5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco5aQ9D9D5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms