Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C6

Ccdc182, Coiled-coil domain-containing protein 182, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc182Q9D9C6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc182Q9D9C6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc182Q9D9C6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc182Q9D9C6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms