Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hcfc2Q9D968 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hcfc2Q9D968 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hcfc2Q9D968 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms