Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atg7Q9D906 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atg7Q9D906 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg7Q9D906 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms