Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Derl3Q9D8K3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Derl3Q9D8K3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Derl3Q9D8K3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms