Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms