Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Med11Q9D8C6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Med11Q9D8C6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Med11Q9D8C6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms