Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27,77■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27,74■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Chmp4bQ9D8B3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Chmp4bQ9D8B3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Chmp4bQ9D8B3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27,57■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Chmp4bQ9D8B3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms