Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn9Q9D805 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Capn9Q9D805 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Capn9Q9D805 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms