Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt34Q9D646 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt34Q9D646 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt34Q9D646 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms