Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PudpQ9D5U5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PudpQ9D5U5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PudpQ9D5U5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms