Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930449I24RikQ9D5E3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930449I24RikQ9D5E3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930449I24RikQ9D5E3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930449I24RikQ9D5E3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms