Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrameQ9D4Z5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrameQ9D4Z5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrameQ9D4Z5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms