Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul2Q9D4H8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cul2Q9D4H8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cul2Q9D4H8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cul2Q9D4H8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms