Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4933428M09RikQ9D3X3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933428M09RikQ9D3X3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933428M09RikQ9D3X3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms