Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Rsph14Q9D3W1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rsph14Q9D3W1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms