Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Klhdc8bQ9D2D9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Klhdc8bQ9D2D9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Klhdc8bQ9D2D9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms