Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Shisal2bQ9D1Y9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shisal2bQ9D1Y9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Shisal2bQ9D1Y9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Shisal2bQ9D1Y9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms