Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms