Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TbcbQ9D1E6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TbcbQ9D1E6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TbcbQ9D1E6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TbcbQ9D1E6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms