Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D131 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D131 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D131 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D131 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D131 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D131 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D131 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D131 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D131 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D131 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D131 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D131 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D131 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D131 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D131 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D131 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D131 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D131 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D131 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D131 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D131 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D131 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D131 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D131 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D131 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D131 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D131 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D131 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D131 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D131 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D131 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D131 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D131 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D131 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D131 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D131 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D131 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D131 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D131 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D131 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D131 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D131 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D131 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D131 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D131 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9D131 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9D131 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms