Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem53Q9D0Z3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tmem53Q9D0Z3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem53Q9D0Z3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms